Трудов стаж при пенсиониране за служител, който погрешка се води на втори ТД

Моля да ми обясните има ли някакво отношение за пенсионирането на служител втория трудов договор по чл. 111?

Служителят е имал основен трудов договор от 2012 г. и от 2012 втори ТД. 2017 г. е прекратен основният трудов договор и НАП е уведомен за прекратяването. 2017 г. е прекратен и вторият трудов договор, като веднага на следващия ден е назначен на основен трудов договор. Въпросът е, че прекратяването на втория трудов договор не е отразено в НАП и там служителят продължава до ден днешен да е на втори трудов договор. Би ли му навредило това неотразяване в НАП за пенсионирането му? И ако е в негов ущърб всичко това недоглеждане от страна на работодателя, какви трябва да са последващите стъпки за разрешаване на казуса?